R语言——生信入门第一步

生信技能树数据挖掘课程学习笔记

一、R与Rstudio

1.什么是R？

2.什么是RStudio？R语言的集成开发环境

3.如何在RStudio中新建项目（R project）

File→New Project→New Directory→New Project→Directory name→Create Project

4.新建脚本

File→New File→R Script

5.RStudio界面介绍

脚本编辑器	environment（对象/变量列表)、history（历史命令)
控制台	文件/图片/帮助/包

6.字号设置

Tools→Global Options →Appearance →Editor Font size

7.与R“交互”的两种方式

用户--发送命令 R --执行并返回结果

（1）控制台窗口

（2）脚本编辑器 脚本的运行方式1.逐行运行 2.选中运行 快捷键：mac是cmd+enter

注释： 使用“#”为脚本添加注释。让自己和其他协作者了解代码的用途。 R自动忽略“#”右侧的任何内容

保存：1.保存+命名 （.R结尾）2.关闭

保存位置：脚本、数据、图片的默认保存位置，也是文件读取的默认位置—工作目录

R语言的几类命令响应

1. 输出结果：命令运行结果、图片 ……
2. 报错：Error：检查命令、检查环境、修正后重新运行
3. 警告：Warning：忽略、后面如有报错或意外结果再检查
4. “没反应”：出现大于号，表示已运行完成
5. 命令正在运行：中止（点击红色键）或等待
6. 命令不完整：补全命令或按ESC键退出
7. 出现提示信息：检查是否有error，没有就可以忽略
8. 进一步选择：不回答就一直问，后面的代码无法运行