IGV展示gff文件

相关文章

• 

  IGV展示gff文件

  1. 加载基因组文件 Genomes➡️Load Genome from File➡️点击自己的基因组 2.加载g...

• 提升IGV打开文件速度

  在使用IGV展示测序深度时，可以用igvtools先计算出tdf文件再导入IGV中，这样比直接导入bam文件快很多...

• 

  山羊转录组GFF文件与GTF格式转换

  GFF文件与GFF文件来源 1.1 GFF文件来源 1.1 GTF文件来源 GFF文件与GTF文件格式 2.1 ...

• awk命令

  GFF文件转换awk '{if(1,5,$9}' md.gff >md1.gff

• 基因组注释文件(GTF/GFF)格式介绍

  基因组注释文件GTF/GFF格式的介绍 GFF 2 -> GTF -> GFF 3 The GTF ...

• annovar：使用gff文件自建数据库注释

  1、gff文件转换gffread：将gff文件转换为gtfgtfToGenePred：将gtf转换为GenePre...

• gtf转化为bed在igv可视化

  bedops可以将gtf较为方便转化为bed文件，但是对在igv中展示基因结构不太适合采用如下python代码可以...

• 

  GFF 文件

  GFF全称为general feature format，这种格式主要是用来注释基因组。 从 Ensembl 导出...

• 

  gbff 文件

  包含基因和序列信息 bp_genbank2gff3.pl脚本可以把gbff文件转化成gff文件

• 

  snp密度图、treemix、D检测

  snp密度图 treemix画图ML树 D检测 （ABBA-BABA test） IGV 读取bam文件 IGV导...