随着高通量测序技术方法的发展和成本的降低,导致生物大数据呈现爆发式增长。为使生物数据得到系统的管理及利用,越来越多的科研工作者选择数据库搭建,其既把多组学数据进行系统的管理、储存,也可以建立在线检索功能和分析服务。
近日,《Molecular Plant》连发了2篇数据库相关文章。第一篇为华中农业大学张建伟教授团队联合国内外多家单位,发表了利用亚洲栽培稻代表性种质的基因组信息,并构建基于同源基因簇的泛基因组数据库Rice Gene Index(https://riceome.hzau.edu.cn)。第二篇文章为中科院遗传发育所联合中科院北京基因组所,通过整合大豆多组学数据,并建立多维组学深度整合数据库SoyOmics(https://ngdc.cncb.ac.cn/soyomics/index)。实际上,在之前的研究中,数据库的身影也频繁出现在高分文章中,由此可见组学数据搭配数据库已成为高分文章发表的流行趋势。
极智基因将生信分析与互联网技术深度融合,开发了极智基因数据库系统,实现多类组学数据的收集与整合、存储与查找、统计与分析等功能,旨在为广大科研工作者提供高效的平台支撑。
极智数据库优势极智基因在重测序数据库、单基因组数据库、泛基因组数据库、种质资源数据库和多组学数据库的搭建上具有丰富的经验。下面以单基因组数据为例随小编了解一下极智数据库的功能吧!
更多详细信息,请访问数据库链接查看。
单基因组数据库:https://sgd.smartgenomics.net/#/home
泛基因组数据库:https://pangd.smartgenomics.net/#/home
重测序数据库:https://rgd.smartgenomics.net/#/home
种质资源数据库:https://grd.smartgenomics.net/#/(植物)、https://grd.smartgenomics.net/#/(动物)
多组学数据库:https://omics.smartgenomics.net/#/home
除了标准数据库,我们也可以根据您的需求和目的,提供定制模块及个性化数据库搭建服务。如果您有任何数据库的相关问题,都可以联系我们。我们会对您的问题进行解答,并给出解决方案。
极智部分已完成数据库案例:
案例1:2022年9月在《Nature Genetics》发表"豌豆ZW6基因组数据库"
https://www.peagdb.com/案例2:2022年10月在《aBIOTECH》发表"植物全基因组LncRNA调控表型数据库"
https://www.lncphedb.com/案例3:2023年1月在《Plant Communications》发表"小麦重测序数据库"
http://www.wheatgab.com
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