可能会用到的R语言包~5

作者: 小明的数据分析笔记本 | 来源:发表于2022-02-08 06:13 被阅读0次

1 ggpmisc

添加回归曲线

2 ComplexUpset

维恩图

3 colorfindr

提取图片中的配色

4 flextable

统计模型快速出表格 参考微信公众号文章《秒速收藏!一行代码出简洁又美丽的回归表格~》
https://davidgohel.github.io/flextable/index.html

5 matrixStats

医学统计与R语言:matrixStats软件包—对行列统计

6 rio

读取excel数据,导出excel数据 公众号推文 《R读取excel文件的最佳方式》

7 furrr

多线程运算R包

8 ggnetwork

网络图
https://cran.r-project.org/web/packages/ggnetwork/vignettes/ggnetwork.html

9 SNPfiltR

处理vcf文件中的snp数据
https://cran.r-project.org/web/packages/SNPfiltR/vignettes/reproducible-vignette.html

10 fastqcr

检查测序文件的质量 https://github.com/kassambara/fastqcr

11 learnr

https://pkgs.rstudio.com/learnr/index.html 交互式学习R

12 lindia

github主页 https://github.com/yeukyul/lindia

13 tayloRswift

ggplot2配色包 用到的颜色是泰勒斯威夫特专辑的封面配色 https://github.com/asteves/tayloRswift

14 ggside

https://cran.r-project.org/web/packages/ggside/vignettes/ggside_basic_usage.html
在图边上加图

15 eulerr

按照实际比例话韦恩图 https://cran.r-project.org/web/packages/eulerr/vignettes/introduction.html

16 janitor

Simple Tools for Examining and Cleaning Dirty Data 这里有一个函数是clean_name()用来修改列名中的特殊字符

17 postcards

Create Beautiful, Simple Personal Websites

18、ggside

在ggplot2作图的边上继续添加图片

19、sjmisc

这个包里有一个函数rotate_df()转置数据框

20、scWGCNA

https://github.com/CFeregrino/scWGCNA 单细胞数据共表达网络分析

21、gtsummary

可以把回归分析的结果直接整理成表格 github主页 https://github.com/ddsjoberg/gtsummary

22、distill

R语言里构建网站 https://distillery.rbind.io/

23、ghibli

https://github.com/ewenme/ghibli 吉普力工作室动画配色R包

24、wesanderson

https://github.com/karthik/wesanderson R语言作图配色包 好像都是老电影的配色
https://moviesincolor.com/

25、prismatic

https://emilhvitfeldt.github.io/prismatic/index.html 也是关于颜色的

26、ggquiver

https://pkg.mitchelloharawild.com/ggquiver/reference/geom_quiver.html 一次性画很多个箭头

27、mmtable2

https://github.com/ianmoran11/mmtable2

28、MLDataR

机器学习数据R包 https://github.com/StatsGary/MLDataR 主要是医学相关的数据

29、ngsReports

https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/ngsReports/inst/doc/ngsReportsIntroduction.html

30、Rfastp

R语言里使用fastp处理fastq数据 http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/Rfastp/inst/doc/Rfastp.html

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