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学习小组Day3笔记——小文

学习小组Day3笔记——小文

作者: 19d858dc33a1 | 来源:发表于2020-09-09 18:42 被阅读0次

    Linux安装软件

    1、Linux怎么安装软件

    conda :Linux系统的应用商店
    在服务期上下载conda或者conda的精简版miniconda

    1.在搜索引擎搜索miniconda
    2.查看自己服务期的配置uname -a
    3.对应自己的服务器位数,在刚刚的官网下载最新版的miniconda,或者其它版本,复制相应链接
    4.在服务器的自己想要的安装目录下使用wget 刚刚复制的链接进行下载miniconda

    1. 安装成功后,source ~/.bashrc,成功

    添加镜像

    # 使用清华镜像
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
    conda config --set show_channel_urls yes
    

    常用命令

    • 查看软件列表:conda list
    • 搜索conda软件 conda search 软件名
    • 安装软件:conda install fastqc -y
    • 卸载软件:conda remove fastqc -y
    • 查看当前环境:conda info --envs
    • 创建环境:conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
    • 激活环境:conda activate XXX
    • 退出环境: conda deactivate
      conda

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