当前,随着拟南芥，水稻等基因组测序的完成以及完整的人类基因组序列即将译解,人类正在从“结构基因组时代”步入“功能基因组时代”。面对大量的信息,近年来发展了多种分析基因表达差异的高通量技术，分析方法主要包括：
1.表达序列标签(EST)比较测序
EST通常是长约150～500 bp的基因表达序列片段，1个EST代表生物体某种组织某一时期的1个表达基因EST技术是1991年建立起来的一种相对简便和快速鉴定大批表达基因的技术。它是将mRNA反转录成cDNA并克隆到载体构建成cDNA文库后．大规模随机挑选cDNA克隆，对其5 或3 端进行一步法测序。所获序列与基因数据库已知序列比较．从而获得对生物体生长发育、遗传变异、衰老死亡等的信息。
2.基因芯片基础上的方法(例如cDNA微阵列);
3.消减克隆,如代表性差异分析(RDA);
4.差异展示(DD);
5.基因表达系列分析(SAGE)
6.DNA芯片
高通量表达谱分析有哪几种？ 当前,随着拟南芥，水稻等基因组测序的完成以及完整的人类基因组序列即将译解,人类正在从“...
mRNA-seq是目前最常用的高通量测序技术，一般的用法就是看看基因表达谱，寻找差异表达的基因。我和高通量测序数据...
添加第一列列名为id 清空空字符 文件保存为csv格式 #表达矩阵 >exprSet=read.csv("PC表达...
现在写表达谱芯片分析教程，就像是落后了几个时代一样。但是 GEO 等数据库包含了大量的芯片表达数据，工作时也难免需...
表达谱案例分析肺癌组织的表达谱分析：选取 2 个肺癌病人（ 5T 和 10T）的组织提取总 RNA，进 行分析。实...
本文取 GSE45636 数据演示单色荧光芯片数据分析。GSE45636 采用 Affymetrix Human ...
本文演示双色荧光芯片数据分析。选取 GSE9187 数据集 GSM232034-GSM232039 样品作为案例，...
本文补充些芯片数据分析注意事项。 GEOquery 与 limma前面文章的分析案例都是从原始数据开始分析，如果想...
本文代码在mac环境下运行 常用的表达谱分析软件： 1.ArrayTools ； 2.DNA-Chip Analy...
表达谱分析中，经常会使用到相关性分析，探索一组基因间的共表达特征。例如，这些基因间的表达是否存在较强的协同性，一个...
本文标题：高通量表达谱分析有哪几种？
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/upxkmltx.html
网友评论