makeblastdb -dbtype prot -in human_protein.fasta -out human_protein
-dbtype：数据类型
-in：输入蛋白组数据
-out：输出库的后缀 最好和蛋白组数据一致。
blastp -num_threads 32 -query rice_sg.txt -db human_protein -out out.txt -max_target_seqs 1 -evalue 1E-10 -outfmt "6 qaccver pident length mismatch gapopen qstart qend sstart send evalue bitscore stitle"
-max_target_seqs：1
-out: 输出名字
主要内容 1 背景 2 在线blast 3 本地blast 3.1 老版本blast 3.2 新版本bl...
建数据库：makeblastdb -in .\miR171.fa -input_type fasta -dbtyp...
为什么选用本地Blast： 我一直有个疑问，NCBI提供了简洁明了的交互式Blast操作界面，Genebank有着...
建立比对数据库makeblastdb -in Ms.Unigene.fa -dbtype nucl -pars...
安装BLAST mamba install -c bioconda blast 构建核酸BLAST数据库，这里因为...
建库 蛋白比对 提取ID seqkit fx2tab swiss-prot.tab -n -i >id.fa bl...
建库 -in：待格式化的序列文件-dbtype：数据库类型，prot或nucl-out：数据库名 比对 -quer...
本地blast后外显子拼接（好记性不如...） 利用TBtools工具进行本地blast大致可分为三大步骤...
blast 安装： 先在网上找到最新版的blast下载到本地；this is the download padg...
blast+的安装 1.程序下载：访问blast本地软件包链接 blast_latest下载适合自己系统的blas...
本文标题：本地blast
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