R语言学习-GEO数据挖掘

作者: 米粥的味道 | 来源:发表于2019-11-24 22:28 被阅读0次

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（1）下载数据及读取

rm(list = ls())

options(stringsAsFactors = F)

library(GEOquery)

eSet <- getGEO("GSE94648",

destdir = '.',

getGPL = F)

exp <- exprs(eSet[[1]])

exp[1:4,1:4]

pd <- pData(eSet[[1]])

gpl <- eSet[[1]]@annotation

save(pd,exp,gpl,file = "step1output.Rdata")

（2）多组数据GEO的R包处理

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