学习小组Day4笔记--蓝天

作者: 蓝天_乎乎 | 来源:发表于2018-10-11 22:49 被阅读49次

    知识诅咒
    所以内行人要理解外行人的诸多提问,虽然这些问题看起来太简单。

    R软件安装

    感谢果子的教程

    1.下载R和RStudio

    R是核心,而RStudio使R的使用更容易
    如同IE和chrome(但是这两个的核心好像有区别),IE和国产浏览器

    2.改镜像

    普通安装R包镜像和bioconductor R包镜像

    #bioconductor
    options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
    #CRAN
    options(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")
    
    #检查是否设定完毕
    getOption("BioC_mirror")
    getOption("CRAN")
    

    3.修改放置R包的文件夹权限

    .libpaths()
    

    4.配置bioconductor安装环境

    source('biocLite.R')
    biocLite()
    

    5.RStudio需要修改成管理员权限打开

    6.安装R包和bioconductor的R包

    BiocInstaller::biocLite(' geoquery  ')
    install.packages(' tidyverse  ')
    

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