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使用FuSeq_WES处理WES数据寻找fusion-gene

使用FuSeq_WES处理WES数据寻找fusion-gene

作者: 面面的徐爷 | 来源:发表于2023-05-16 19:08 被阅读0次

    数据比对

    bwa mem -t 10  ~/genome/BWA_index/GRCh38 1.rawdata/xyz-R1.fastq.gz 1.rawdata/xyz-R2.fastq.gz | samtools sort -@ 10 -o xyz.bam -
    samtools index xyz.bam
    

    使用FuSeq_WES

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