数据比对
bwa mem -t 10 ~/genome/BWA_index/GRCh38 1.rawdata/xyz-R1.fastq.gz 1.rawdata/xyz-R2.fastq.gz | samtools sort -@ 10 -o xyz.bam -
samtools index xyz.bam
使用FuSeq_WES
bwa mem -t 10 ~/genome/BWA_index/GRCh38 1.rawdata/xyz-R1.fastq.gz 1.rawdata/xyz-R2.fastq.gz | samtools sort -@ 10 -o xyz.bam -
samtools index xyz.bam
本文标题:使用FuSeq_WES处理WES数据寻找fusion-gene
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/uyebsdtx.html
网友评论