导语:2020年06月03日,来自美国耶鲁大学的Parker L. Sulkowski等在Nature上发表了题为“Oncometabolites suppress DNA repair by disrupting local chromatin signalling”的研究文章,该研究揭示了代谢物(2HG、琥珀酸、延胡索酸)干扰DNA修复的通路。肿瘤细胞代谢物通过抑制组蛋白去甲基化酶KDM4B的活性,造成DNA断裂位点的H3K9me3高甲基化,从而影响同源重组修复HDR。随后,HDR关键分子TIP60和 ATM及下游修复因子在DNA断裂位点富集减少。因此,该研究为肿瘤代谢物诱导的HDR抑制提供了分子机理,为肿瘤治疗提供了潜在治疗策略。
Parker L. Sulkowski, et al., Nature (2020)
背景
代谢物紊乱及基因组完整性破坏是肿瘤的标志。人类恶性肿瘤中IDH1或IDH2、FH及SDHA,SDHB,SDHC和SDHD的体细胞突变分别导致肿瘤代谢物2HG、琥珀酸、延胡索酸水平上升。近期有研究表明这些代谢物与DNA修复相关,即这些代谢物抑制HDR通路,并适度增加肿瘤对PARP抑制剂的敏感性。但是,这些代谢物抑制HDR通路的机制仍然不清楚。
肿瘤代谢物2HG、琥珀酸、延胡索酸可以抑制a-KG依赖的双加氧酶,包括组蛋白去甲基化酶KDM4A、KDM4B。
关键科学问题
肿瘤代谢物2HG、琥珀酸、延胡索酸抑制HDR通路的机制是什么?
组蛋白去甲基化酶KDM4A、KDM4B是否参与肿瘤代谢物2HG、琥珀酸、延胡索酸抑制HDR的过程?
结果
Fig 1:肿瘤代谢物直接抑制HDR。
Fig 2:肿瘤代谢物抑制HDR因子向DNA双链断裂位点DSBs的逐步招募过程。
Fig 3:肿瘤代谢物通过抑制KDM4B来抑制HDR。
Fig 4:异常的H3K9甲基化破坏HDR,从机理上揭示了肿瘤代谢物诱导的HDR缺陷。
总结
肿瘤异常水平的代谢物通过“代谢物-KDM4B-H3K9高甲基化-HDR因子招募”的通路,来影响DNA修复,并增加肿瘤对PARP抑制剂的敏感性。
通讯作者
Peter M. Glazer
Peter M. Glazer, MD, PhD
Robert E. Hunter Professor of Therapeutic Radiology and Professor of Genetics;
Chair, Department of Therapeutic Radiology;Yale University School of Medicine。
主要经历:
PhD:Yale University (1987)
MD:Yale University (1987)
MSc:University of Oxford, Biochemistry (1981)
BA:Harvard University, Chemistry (1979)
Resident:Yale-New Haven Hospital
Board Certification:AB of Radiology, Radiation Oncology (1992)
主要研究:
1,Tumor hypoxia, DNA repair, and cancer therapy;
2,Oncometabolites and DNA repair;
3,DNA repair inhibitors for cancer therapy;
4,Tumor specific targeting of microRNAs and other undruggable targets;
5,Gene editing via triple helix formation。
Ranjit S. Bindra
Ranjit S. Bindra, MD, PhD
Associate Professor of Therapeutic Radiology,Yale University School of Medicine。
主要经历:
MD:Yale University School of Medicine (2007)
PhD:Yale University Graduate School (2005)
BS:Yale University (1998)
Resident:Memorial Sloan-Kettering Cancer Center
Intern:Memorial Sloan-Kettering Cancer Center
Board Certification:AB of Radiology, Radiation Oncology (2013)
主要研究:
1,Development of novel cell-based assays for high-throughput screening;
2,Development of synthetic lethal targeting strategies。
参考资料
https://medicine.yale.edu/profile/peter_glazer/?tab=research
https://medicine.yale.edu/research-profile/ranjit_bindra/?tab=research
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