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2021-03-01生信技能树-生信入门D1

2021-03-01生信技能树-生信入门D1

作者: 超级可爱的懂事长鸭 | 来源:发表于2021-03-02 15:39 被阅读0次

生信技能树2021生信入门线上课笔记,需要结合课程讲解服用

R:用函数处理数据,函数存在于R包中

用户发送命令,R执行并返回结果

交互式会话session

1.新建project成功的标志,看Rstudio右上角出现输入project的名称

一切围绕project,一个项目一个project

1 project.png

2.新建脚本(代码组织成的文件)

把正确的代码保存成脚本方便以后调取

2 脚本.png
  1. run Windows快捷键control+enter

  2. 井号#后面写注释,不会被运行

5.脚本的保存.R结尾,保存到R project的文件夹里(工作目录)

3 工作目录.png
x1 = read.csv("x.csv")  #读取放在工作目录下的文件

head(x1)

pdf("x.pdf")

plot(x1$len,col = factor(x1$dose))

title("Have a try")   #画的图保存于PDF,工作目录

dev.off()    #关闭

write.table(x1,"x.txt")

7.error:检查命令,环境,修正后重新运行

Warning:可以忽略,仅是温馨提示,后面有报错或者意外结果再检查

出现大于号,表示已经运行完成;没有大于号表示正在运行,按esc或者红色键终止

出现+,表示命令不完整,补全命令或者esc退出

出现提示信息,没有error就可以忽略,有问题就回答

8.数据类型

数值型

字符型:“” ’’ 双/单引号

逻辑型:TRUE,FALSE,NA(缺失,不是不存在)

【Null:没有,不存在】

判断数据类型的函数:class()

9.R语言严格区分大小写

问号在哪里,哪里的字符是不识别的,注意中英文字符

输入函数前几个字母,用上下键选择,之后用tab或者enter选择,可输入带括号的函数

光标放在大于号后面,用上下键选择之前运行过的代码

10.Markdown 写笔记 简书里面有教程

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