生信技能树2021生信入门线上课笔记,需要结合课程讲解服用
R:用函数处理数据,函数存在于R包中
用户发送命令,R执行并返回结果
交互式会话session
1.新建project成功的标志,看Rstudio右上角出现输入project的名称
一切围绕project,一个项目一个project
1 project.png2.新建脚本(代码组织成的文件)
把正确的代码保存成脚本方便以后调取
2 脚本.png-
run Windows快捷键control+enter
-
井号#后面写注释,不会被运行
5.脚本的保存.R结尾,保存到R project的文件夹里(工作目录)
3 工作目录.pngx1 = read.csv("x.csv") #读取放在工作目录下的文件
head(x1)
pdf("x.pdf")
plot(x1$len,col = factor(x1$dose))
title("Have a try") #画的图保存于PDF,工作目录
dev.off() #关闭
write.table(x1,"x.txt")
7.error:检查命令,环境,修正后重新运行
Warning:可以忽略,仅是温馨提示,后面有报错或者意外结果再检查
出现大于号,表示已经运行完成;没有大于号表示正在运行,按esc或者红色键终止
出现+,表示命令不完整,补全命令或者esc退出
出现提示信息,没有error就可以忽略,有问题就回答
8.数据类型
数值型
字符型:“” ’’ 双/单引号
逻辑型:TRUE,FALSE,NA(缺失,不是不存在)
【Null:没有,不存在】
判断数据类型的函数:class()
9.R语言严格区分大小写
问号在哪里,哪里的字符是不识别的,注意中英文字符
输入函数前几个字母,用上下键选择,之后用tab或者enter选择,可输入带括号的函数
光标放在大于号后面,用上下键选择之前运行过的代码
10.Markdown 写笔记 简书里面有教程
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