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2021-03-01生信技能树-生信入门D1

2021-03-01生信技能树-生信入门D1

作者: 超级可爱的懂事长鸭 | 来源:发表于2021-03-02 15:39 被阅读0次

    生信技能树2021生信入门线上课笔记,需要结合课程讲解服用

    R:用函数处理数据,函数存在于R包中

    用户发送命令,R执行并返回结果

    交互式会话session

    1.新建project成功的标志,看Rstudio右上角出现输入project的名称

    一切围绕project,一个项目一个project

    1 project.png

    2.新建脚本(代码组织成的文件)

    把正确的代码保存成脚本方便以后调取

    2 脚本.png
    1. run Windows快捷键control+enter

    2. 井号#后面写注释,不会被运行

    5.脚本的保存.R结尾,保存到R project的文件夹里(工作目录)

    3 工作目录.png
    x1 = read.csv("x.csv")  #读取放在工作目录下的文件
    
    head(x1)
    
    pdf("x.pdf")
    
    plot(x1$len,col = factor(x1$dose))
    
    title("Have a try")   #画的图保存于PDF,工作目录
    
    dev.off()    #关闭
    
    write.table(x1,"x.txt")
    

    7.error:检查命令,环境,修正后重新运行

    Warning:可以忽略,仅是温馨提示,后面有报错或者意外结果再检查

    出现大于号,表示已经运行完成;没有大于号表示正在运行,按esc或者红色键终止

    出现+,表示命令不完整,补全命令或者esc退出

    出现提示信息,没有error就可以忽略,有问题就回答

    8.数据类型

    数值型

    字符型:“” ’’ 双/单引号

    逻辑型:TRUE,FALSE,NA(缺失,不是不存在)

    【Null:没有,不存在】

    判断数据类型的函数:class()

    9.R语言严格区分大小写

    问号在哪里,哪里的字符是不识别的,注意中英文字符

    输入函数前几个字母,用上下键选择,之后用tab或者enter选择,可输入带括号的函数

    光标放在大于号后面,用上下键选择之前运行过的代码

    10.Markdown 写笔记 简书里面有教程

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