本文译自加州大学旧金山分校PhD Emily的博文。
原文链接：Tips for writing your first scientific literature review article
当我2010年开始着手写科学型文献评论文章（literature review）时，我当时希望能够通过谷歌搜索从资深人士那里学习这些特定文章的写作技巧，但我没有收获，所以我自己开始思考如何进行这类文章的写作。我现在正为其他遇到类似情况的年轻科学家提供这些技巧。你现在正在阅读的基本上是众多案例中的一个，这是我希望当初写作时可以参考的内容。
2010年2月一个星期天晚上，当我的导师找我聊关于共同创作（这里作者使用的是co-authoring一词）一篇关于生物化学年度回顾的评论文章（review）时，我正在镍柱上捣鼓一种蛋白质~我的导师是一个大忙人，有许多的文章要跟进，许多的课题要做，所以我知道所谓的“co-author”说白了就是让我担当主要的角色，我是那篇评论文章的主要研究者和写作者，我可以从他那里得到大部分的指导性建议。这对我而言也是好事，当时我是5年纪的研究生，我学会了应对，甚至更喜欢独立自主科研。说实话，我很高兴可以利用这次机会深入研究同领域的文献，并从中创造出有用的东西。评论文章的完成截止日期是八月，所以我有六个月的时间将几十年来关于我们review的主题的已发表的有价值的研究文献综合成一个大小适宜、包装精美的事实和解释。
Getting started
我们的主题是半胱天冬酶底物，这是一组对程序性细胞死亡至关重要的蛋白质，因此对我们理解如何杀死癌细胞非常重要。使用PubMed对“半胱天冬酶底物”关键词进行搜索，得到了超过2000篇的研究文献...我没有幻想过这个项目可以接近全面，幸运的是我的导师也没有。我必须评估期刊施加的限制（30页，6个月），以及我自己的有限精力，我必须平衡写作时长和完成PhD所需的实验工作所需的时长。
缩小评论文章的主题范围可能是写作过程的最大挑战。
当我一次专注于一个项目时，我知道自己的工作会做得更好，于是接下来的两个月里，我只专注于考虑评论文章并在有空时就浏览文献，这期间我停掉了所有日常实验工作的时间。那段时间我变成了全天阅读和写作。我找到了附近一家我喜欢的咖啡馆，几乎那个夏天的每个早上都在那喝茶，吃着南瓜松饼，在笔记本上工作着。下午我常常在公寓或学习图书馆写作。我知道我在拥挤嘈杂的实验室写作是不可能的，但每周花些时间与实验室同仁讨教（consulting）我的文献研究，跟上实验室业务和八卦，看看实验台面都是必不可缺的~
The finished product
写作的过程中有许多时候我感到不知所措，并没找到按时完成评论文章的明确途径。我试图通过记住大学时期擅长写作来安慰自己；但这是一个更大的任务，有可能对某人、某地，以及那些想要了解和学习半胱天冬酶底物的人们产生影响。最后，我在截止日期前完成了写作（另外加上编辑同意授予我两周延期的时间），我对产出的文章、学习到的有关半胱天冬酶底物的知识、科学文献的研究，以及评论文章的写作过程都感到非常满意。但我估计下次承担这样的任务时，我可以在一半的时间内完成。我希望下述tips可以帮助到那些处于这种未知领域的科学家。
最后，我要提到的是，对我来说，这是我博士期间获得的最有价值的经历之一。将全世界各地科学家所做的实验中的各种数据提炼成为一个连贯的故事，结果非常满意。我期待未来还有机会再做这样的任务，届时也许是以更有效的方式完成评论文章的写作。
Tips
1. 定义文章的范围。
写作之前先制作一个大纲，保留在你的范围内，和不在你的范围内的主题列表，提醒自己任何时候文献超出了你的文章讨论范围时，就要立刻停止阅读。我和导师决定将写作的前半部分时间用于广泛搜索领域内的关键研究主题，如半胱天冬酶-底物相互作用的物理细节，并将后半部分时间用于查找数百种已知半胱天冬酶底物中的某几种半胱天冬酶底物的若干高度详细的小插图。
2. 你的同事和合作者是非常宝贵的资源。
每个人都可能有和你略有不同的特定专业领域。问问同事他们给轮换学生（rotation student）阅读的是哪些文章，以及最近该领域取得的最重要进展。（小心不要让这个建议误导你走至其他方向，你的同事的想法可能在开始时帮你确定你的评论文章的主题范围，但如果你觉得它们当中有些没有相关性时则不必整合他们的所有建议。）
*3. 不要局限于已发表的同主题的评论文章。
这很快会成为一个黑洞，耗费时间并且让你对尝试为该领域做出贡献产生不必要的安全感。但是你需要熟悉这些文章的内容。查找尚未经过彻底评论的区域，或者那些你认为自己对旧数据有了新的看法的部分。可能发生的最痛苦的事情之一是花费了数天阅读和写作，之后发现这已经是其它评论文章的内容的一部分，于是只能引用文章，得出相同的结论。
4. 让自己舒服。
看来简单，实则非常重要。找一个可以让自己专注的地方写作，可以经常休息、舒展、吃零食，甚至出去走几分钟。在我挣扎着专注写作的日子里，我经常使用计时器来度过我的一天。我会工作60分钟，休息一下，然后再工作60分钟，继续工作。
*5. 对科学文献的混乱构建一些结构。
我为每个我想要review的研究主题（包括前半部分的关键词广泛调查，和下半部分的插图部分）制定了一个策略。
5.1 搜索和主题相关的最新文章，阅读这些论文，挑出我认为重要的文章，最后挑选出10篇关键的文章。
5.2 快速阅读关键论文，为每一篇做总结，通常以每个图中得出的结论的形式，组织符号列表进行summary。（这里个人建议可以引入幕布~）
5.3 将5.2的summary组合成一张单一的表格，每篇研究文章位于表格的一行（按出版日期排列），文章对应的研究结果或结论位于表格的一列。（这里个人建议使用幕布导出思维导图）
5.4 通过5.3观察哪些文章就哪些主题达成一致？随着时间的推移出现了什么趋势？以及该领域的争议在哪里？
我发现，一旦我制作了这样一张表格，那个特定的研究主题的叙述/故事部分几乎自成一文！
*6. 花时间写作时关闭所有的PDF文件和网页浏览器，桌面也没有任何纸张。
这是距离文章截止日期前一个月时导师给我的建议，当时他看出来我的大脑和PDF库充满了数据，而我正努力从中产出文字内容。起初远离这些辅助并不容易。我不想出错，即使是草拟的内容，所以我害怕在没有引用文献做支撑的情况下输入哪怕只是一句话。另一方面，因为有互联网和PDF文件摆在那里，我倾向于写一些信息量非常密集但并不一定彼此密切相关的句子。我开始在写作方面真正取得进展时是在八月份，下午我会坐在公寓的屋顶甲板上写作，那段时间，只有纸笔，没有可以上网的设备。是的，有时候通过记忆构建一个部分时，会写了一些错的东西（至少不是完美的）。尽管如此，往往最终会得到一个强大的构架，我可以在其上添加一些密集的事实陈述的句子。
7. 不要羞于明确定义你在共同作者中的角色。
在写作开始前，甚至整个过程中，如果你感觉有需要修改的地方，不要羞于明确定义你在共同作者中的角色。定义角色对我而言不难，因为我和导师都偏向于我做主要的研究者和写作者，导师则扮演高级别的顾问角色。但是我敏锐地意识到其他案例中，几乎没有合情合理意气相投的情况。
*8. 仔细阅读杂志期刊的提交说明（instructions for submissions）。
你应该找到杂志编辑的email地址，不要羞于提问。不要忽略期刊的页面限制或格式要求。密切关注图片的数字要求，确保评论文章获得重现任何所需数字的权限。（这通常是通过遵循原始图形数字出现的期刊网站上的权限要求来完成的。向制作数字的作者发邮件告知你将使用他们的数据是个好主意。）
9. 熟悉PDF管理软件的使用，EndNote和Adobe Illustrator（或杂志建议的图形软件）。
对我来说，在线Adobe Illustrator教程提供了很好的休息时间，当我阅读几小时后，我可以看看它。
*10. 你的同事和合作者可以帮助你完成编辑过程。
不要让一两个人帮助你编辑整篇文章，最好将文章分成几个部分，并向另一位同事请求他/她的专家帮助修改一个他/她熟悉的主题部分。另外一个策略是将你的文章的部分内容或完整文章给一年级研究生或一个领域不同的科学家看，他/她是你的受众目标，看他们有何建议，如果有需要修改而使表述变得更清楚明了的地方，他们会告诉你。
读后感：
构建框架、专注写作，以及交流是至关重要的！当然，导师的支持尤其重要！
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