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在线进行ROC曲线分析(一):单指标类型

在线进行ROC曲线分析(一):单指标类型

作者: OmicStudio | 来源:发表于2020-09-10 10:13 被阅读0次

ROC曲线(receiver operating characteristic curve)是一种评价二值分类器(binary classifier)的优劣的常见方法,在生物医学领域,现在主要应用于判断某因素对于疾病的诊断价值,筛选可靠的biomarker。联川生物ROC曲线工具现已开放,可以应用于单指标诊断效果、多指标效果比较及多指标联合诊断效果评估等,使用简单、应用广泛。


OmicStudio在线绘制ROC曲线_腾讯视频

1.打开云工具

点开ROC曲线分析云工具:https://www.omicstudio.cn/tool/58,选择左侧开始绘制页面。

2.上传数据

打开工具是默认使用示例数据,如果需要使用自己的数据进行图片绘制,需要打开页面上方绘图数据+,展开数据上传模块,然后分别上传输入数据分组信息共两种表格。

输入数据表格格式如下(第一列为样本名称,第二列为指标丰度),也可以点击下载图标查看示例数据格式。

分组信息表格格式如下(第一列为样本名称,第二列为分组名称),也可以点击下载图标查看示例数据格式。

3.完成绘图

点击下方开始绘制按钮,稍等片刻即可完成图片绘制。

4.细节调整

图片的相关调整参数可以在下方参数调整进行修改。

(1)组别选择:ROC曲线分析的是二元分类模型,也就是只能包含两组类别,例如阴性/阳性,正常/疾病等,因此对于分组表格大于3组的数据,需要先选择两个分组。

(2)线条粗细:默认的线条粗细可以自行修改。

(3)区域多边形:对于单指标绘制的ROC曲线,可以进行区域多边形绘制,并自行选择颜色。

(4)平滑曲线:根据您的绘图需求,也可以将折线改成平滑曲线样式。

(5)置信区间:可以在非平滑曲线条件下,绘制置信区间,并自定义颜色和样式。

(6)图例位置:可以根据展示情况,自定义图例的位置。

5.图片下载

图片调整完毕后,可以点击结果下载的+图标,展开下载框,选择需要的图片类型,点击结果下载即可完成图片下载。

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