2019-06-17 homer motif结果作气泡图

作者: njmujjc | 来源:发表于2019-06-17 20:57 被阅读0次

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y<- read.table("motif-logP.txt",sep= "," , header= T)

head(y)

motif logPvalue type

1 RBPJ -1281.00 Female-ko

2 LEF1 -1472.00 Female-ko

3 PRDM1 -683.00 Female-ko

4 NKX2.1 -992.10 Female-ko

5 TCF3 -1513.00 Female-ko

ggplot(y,aes(type,motif))+geom_point(aes(size=-logPvalue))+theme_minimal()+xlab(NULL)+ylab(NULL)+scale_size_continuous(range=c(1, 12))+theme(axis.text.x=element_text(size=13,angle=-30),axis.text.y=element_text(size=15,family="myFont"))

##有fpkm的话 aes(color=FPKM)

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