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R语言输出ppt可编辑的图片

R语言输出ppt可编辑的图片

作者: Seurat_Satija | 来源:发表于2021-08-02 20:45 被阅读0次

    ggplot2程序包的加持下,R语言可以做出非常漂亮的统计图出来。然而大家是否会有这样的体会,为了做出理想的图片,需要不停的调整作图的参数,包括颜色,字体大小,字体格式,注释的位置,非常麻烦。尤其是与别人进行科研合作,图片的绘制需要不停地进行沟通,甚至需要动用PS,GIMP等工具。

    大家有没有想过可以像下面的动图展示的那样,可以对图片的任意元素进行修改呢???

    本文给大家介绍一种解决方案,可以将R语言绘制的图片以元数据(点,线,面,颜色,形状等等)的方式保存到PPT文件中,在PPT中进行修改。

    image

    软件包

    • officer程序包:一个从R端访问和编辑word和PPT文件的程序包。
    • rvg程序包:一个为PPT和Excel生成矢量图的程序包。

    两款程序包,均可以从CRAN进行安装,安装命名如下:

    install.packages(c('officier', 'rvg'))
    
    

    实现方法

    1. R图格式转换
      通过rvg中的dml函数进行转换,可以将R生成两类图,Graphics和ggplot图,转换成PPT可以直接导入的格式。
    • Graphics图: 首先找一段生成决策曲线的代码
    data(dcaData)
    set.seed(123)
    baseline.model <- decision_curve(Cancer~Age + Female + Smokes,
                                    data = dcaData,
                                    thresholds = seq(0, .4, by = .005),
                                    bootstraps = 10)
    full.model <- decision_curve(Cancer~Age + Female + Smokes + Marker1 + Marker2,
                                data = dcaData,
                                thresholds = seq(0, .4, by = .005),
                                bootstraps = 10)
    
    plot_decision_curve( list(baseline.model, full.model),
                        curve.names = c("Baseline model", "Full model"),
                        col = c("blue", "red"),
                        lty = c(1,2),
                        lwd = c(3,2, 2, 1),
                        legend.position = "bottomright")
    
    

    最后的代码段是作图的命令,我们只需要将最后一段进行如下操作,即将其赋值给dml函数的code参数。

    p.dca <- dml(code = {
      plot_decision_curve( list(baseline.model, full.model),
                        curve.names = c("Baseline model", "Full model"),
                        col = c("blue", "red"),
                        lty = c(1,2),
                        lwd = c(3,2, 2, 1),
                        legend.position = "bottomright")
    })
    
    
    • ggplot图:同样找一段生成频数分布对比柱状图的代码:
    ggbarstats(
      data = mtcars,
      x = vs,
      y = cyl
    )
    
    

    对该作图代码做如下修改,将它赋值给dml函数中的ggobj参数:

    p.bar <- dml(ggobj = {
      ggbarstats(
      data = mtcars,
      x = vs,
      y = cyl
    )
    })
    
    
    1. 导入PPT
      使用officier包将前面生成p.dcap.bar输出到PPT中。会用到以下函数:
    2. 打开PPT--read_pptx
    3. 添加页面--add_slide
    4. 导入图片--ph_with
    5. 保存PPT--print
      具体操作如下:
    pptx <- read_pptx()
    pptx <- add_slide(pptx)
    ph_with(pptx, value = p.dca, 
            location = ph_location_type(type = 'body'))
    
    pptx <- add_slide(pptx)
    ph_with(pptx, value = p.bar, 
            location = ph_location_fullsize())
    
    print(pptx, 'output.pptx')
    

    作者:小蜜蜂Stats
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