@[TOC](SraToolkit 下载与安装)

第一步：进入NCBI选择“Download”, 进入后选择“Download Tools”工具下载。

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第二步：选择“SRA Toolkit”的“Download”按钮，进入版本选择，此处我选择的是“CentOS Linux 64 bit architecture ”，若想在linux系统中下载，可选择右键“复制链接地址”，然后到linux系统中用wget命令获取。

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获取sra toolkit文件：

wget https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.10.8/sratoolkit.2.10.8-centos_linux64.tar.gz

第三步：安装与使用

此安装包为免安装包，解压即可使用，但是需先配置存储位置。

tar zxvf sratoolkit.2.10.8-centos_linux64.tar.gz
cd sratoolkit.2.10.8-centos_linux64/bin
vdb-config -i #配置存储位置

使用方法也比较简单：

prefetch SRR1036346 # SRR1036346为你想要获取的sra数据编号
# fastq_dump可将sra数据转化为fastq格式数据
fastq_dump --split-e SRR1036346.sra
# fasterq_dump支持多线程
fasterq_dump --split-3 SRR1036346.sra -e 10 -o SRR1036346
# 若为双端数据，则会产生两个数据，分别为SRR1036346_1.fastq 和 SRR1036346_2.fastq；若为单端数据，则只有一个数据，为SRR1036346.fastq.