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配制在线版r-studio

配制在线版r-studio

作者: 云养江停 | 来源:发表于2021-10-13 21:13 被阅读0次

相信大家都用过本地版的 Rstudio,也时常被电脑卡死所困扰,也有用自己笔记本处理单细胞数据内存不够的 error,怎么解决?

Rstudio 官方其实有个可以在本地服务器安装的 server 版,也就是使用服务器的硬件配置,用自己的工作电脑登录浏览器就可以使用,避免以上问题。

那么接下来,和我一起配置起来:

测试环境

服务器系统:Debian 10 / Ubuntu 18 / Ubuntu 20

R版本:> 3.0

安装

1****安装 R 和 Rstudio 包

 sudo apt-get install r-base
 sudo apt-get install gdebi-core
 wget https://download2.rstudio.org/server/bionic/amd64/rstudio-server-2021.09.0-351-amd64.deb
 sudo gdebi rstudio-server-2021.09.0-351-amd64.deb

安装完成后如图所示:

图片

现在回到你的浏览器中输入:your_id:8787

即可看到登录页面,这里输入用户名和密码即可登录

图片

登录后,与本地版 Rstudio 界面与用法相同

如果登录不了,可能原因是防火墙拦截端口

需要安装

sudo apt-get update 
sudo apt-get install iptables
sudo apt-get install iptables-persistent

运行命令

 # 开放端口
 iptables -I INPUT -p tcp --dport 8787 -j ACCEPT
 iptables -I OUTPUT -p udp --dport 8787 -j ACCEPT
 # 保存防火墙规则, /etc/iptables/rules.v4
 sudo netfilter-persistent save

常用操作

#重启
 sudo rstudio-server restart
#启动
 sudo rstudio-server start
#关闭
 sudo rstudio-server stop
#检测配置文件,配置文件后,用于文件自检

 sudo rstudio-server verify-installation
#查看状态 按 q 退出
sudo rstudio-server status

正在运行状态

图片

停止运行或运行错误状态

图片

安装完成后,会有两个 Rstudio-server 配置文件,如果不存在手动创建即可

!!!如果不清楚配置选项意义,请勿更改,可以会引起 Rstudio server 运行异常

 /etc/rstudio/rserver.conf
 /etc/rstudio/rsession.conf
#rserver.conf 配置清单
 # 监听端口,默认为 8787
 www-port=8787
 # 地址,默认为0.0.0.0,会接收任何IP连接
 www-address=0.0.0.0
 # 指定库文件路径,一般不需要改动,可以用于添加系统标准库,第三方外部库文件依赖
 rsession-ld-library-path=/opt/local/lib:/opt/local/someapp/lib
 # 指定 R 路径
 rsession-which-r=/usr/local/bin/R
 # 设置用户权限
 auth-required-user-group=rstudio_users
rsession.conf 配置清单
 # 会话超时,默认 2 小时 Rstudio 没有操作就会断开服务器连接,如果有任务运行这不会断开
 session-timeout-minutes=120
 # 设置R包路径,默认在~/R/packages
 r-libs-user=~/R/packages
 # 镜像设置
 r-cran-repos=https://mirrors.nics.utk.edu/cran/

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