python39

作者: rong酱 | 来源:发表于2023-01-14 12:51 被阅读0次
    #!/usr/bin/env python
    ##coding=utf-8
    
    import re
    import os
    import sys
    import argparse
    import gzip
    
    parser = argparse.ArgumentParser(description="")
    parser.add_argument('-i', '--input', help = 'the pathway of the input fastq file ', required = True)
    parser.add_argument('-o', '--output', help = 'the pathway of the output vcf file,filter vcf', required = True)
    argv = vars(parser.parse_args())
    ifile = os.path.abspath(argv['input'].strip())
    ofile = os.path.abspath(argv['output'].strip())
    
    def lenght(inf,ouf):
        ouc=open(ouf,'w')
        with open(inf,'rb') as v:
            for vi in v:
                vic = vi.strip().split('/')
                lv=str(vic[-1]).strip().split('_')
                lvs=int(lv[0])
                lve=int(lv[1])
                lenlv=lve-lvs
                zwid='/'.join(vic)
                ouc.write(str(zwid)+"\t"+str(lenlv)+"\n")
    

    默默加班2天
    众人之中,独自摇晃的红酒杯
    空无一人,独自干活的身影
    略微懂得
    follow you want to do
    世界很大
    --2023年1月15日

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