美文网首页
fasta格式转fastq格式

fasta格式转fastq格式

作者: 今天没回家 | 来源:发表于2021-07-22 21:03 被阅读0次

比对软件比如bowtie并不支持比对fasta格式的文件,所以需要把fasta转为fastq格式,但是fasta和fastq相比缺少质量值,所以只能伪造一个加上去,这里用到seqtk来伪造,从而把fasta格式转fastq格式。

seqtk seq test.fa -F  "J" > test.fq

OK了

相关文章

网友评论

      本文标题:fasta格式转fastq格式

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/wjpymltx.html