比对软件比如bowtie并不支持比对fasta格式的文件,所以需要把fasta转为fastq格式,但是fasta和fastq相比缺少质量值,所以只能伪造一个加上去,这里用到seqtk来伪造,从而把fasta格式转fastq格式。
seqtk seq test.fa -F "J" > test.fq
OK了
比对软件比如bowtie并不支持比对fasta格式的文件,所以需要把fasta转为fastq格式,但是fasta和fastq相比缺少质量值,所以只能伪造一个加上去,这里用到seqtk来伪造,从而把fasta格式转fastq格式。
seqtk seq test.fa -F "J" > test.fq
OK了
本文标题:fasta格式转fastq格式
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