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生物信息分析常用文件格式和软件

生物信息分析常用文件格式和软件

作者: 超人立志做国王 | 来源:发表于2019-05-24 12:33 被阅读20次

    生物信息分析常用文件格式和软件

    文件格式

    数据格式

    • fastq
    • fasta

    注释

    • gtf
    • gff
    • bed
    • bcf

    比对格式

    • sam
    • bam

    工具类

    数据质控类

    • cutadapt
    • fastp
    • trimmomatic
    • fastx-toolkit

    序列处理类

    • seqkit
    • seqtk

    工具类

    • samtools
    • bedtools
    • bedops
    • bcftools
    • pysam
    • gffutils

    比对软件

    • bwa
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    • bowtie2
    • tophat
    • hisat2

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