自然人股东转让股权，当初取得股权时只有认缴资金，没有实缴金额，请

根据《国家税务总局关于发布<股权转让所得个人所得税管理办法（试行）>的公告》（国家税务总局公告2014年第67号）第十五条规定，以现金出资方式取得的股权，按照实际支付的价款与取得股权直接相关的合理税费之和确认股权原值。因此，自然人股东未缴足资本的部分不得计入股权原值。