| code | 含义 |
|---|---|
| pwd | print working directory，显示当前路径 |
| mkdir | make directory， 创建空目录 |
| mkdir -p | 后跟路径，一次性创建多级目录 |
| ls | list，显示目录&文件 |
| -t | 按照时间排序 |
| -h | 显示文本大小 |
| -l | 显示长的完整信息 |
| -a | 隐藏文件 |
| -r | 逆向 |
| rm | remove, 删除 |
| rmdir | 删除空目录 |
| rm -r | 删除非空目录 |
| rm -rf | 强制删除 |
| cd | change directory, 返回目录 |
| cd .. | 返回上一级目录 |
| vi | 新建脚本或文本文档 |
| cat | 查看全文并将内容输出至屏幕 |
| cat -n | 查看，输出，加上行号 |
| cp file1 file2 | 将文件1复制为文件2 |
| mv file /root/路径 | 移动 |
| mv file1 file2 | 将file1名称改为file2 |
conda使用相关
| code | 含义 |
|---|---|
| conda list | 查看已安装的软件 |
| conda search fastqc | 搜索软件 |
| conda install fastqc -y | 安装 |
| conda install fastqc=0.11.7 -y | 指定版本号安装 |
| conda remove fastqc -y | 卸载 |
定制conda环境
| code | 含义 |
|---|---|
| conda info --envs | 查看有哪些conda envs |
| conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y | 新建 conda envs |
| conda activate rna-seq | 激活conda envs |
| conda remove -n rna-seq fastqc -y | 卸载conda envs中的软件 |
| conda deactivate | 退出当前环境 |
| conda remove -n rna-seq --all | 卸载整个环境 |
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