笔记来自生信星球学习小组资料

Day3 学习内容-Linux软件安装

---

1.思维导图镇楼

Day3 思维导图

2.准备工作

#登录服务器
ssh root@服务器地址
#检查管理压缩包软件
bzip2 
#没有则安装
yum install -y bzip2 

3.Miniconda-linux appstore

#下载软件
wget 下载链接 
 #安装软件
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 
#激活软件
source ~/.bashrc 
#国内使用清华镜像，下载更快
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
#查看软件列表
conda list
#搜索软件
conda search 软件名
#安装软件
conda install 软件名 -y  #-y自动安装
#卸载软件
conda remove 软件名 -y
#查看conda 环境，个体化的工作环境
conda info --envs 
#添加新环境
conda create -n name software1 software2 -y
#激活新环境
conda activate name # name shows before root name
#卸载环境
conda remove -n name --all

---

editted by
Kan 
19.06.2019