学习小组Day3笔记--马小林

1、如何安装miniconda

下载miniconda

①登陆miniconda清华镜像
②检查服务器是多少位的

uname -a

③选择相同位数的最新版本linux的miniconda，复制链接
④在Xshell中运用wget指令

cd biosoft
wget +右键粘贴网址

安装miniconda

bash Miniconda3-lastest-Linux-x86_64.sh  #sh是脚本文件的后缀，安装失败后应从安装开始重新做

安装过程中的版权信息用回车跳过，过程中让yes就yes，让enter就enter

激活miniconda

source ~/.bashrc
conda #出现各种信息说明激活成功，如果不成功就删除目录，从安装步骤开始重新来

添加镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

上述镜像代码摘自生物星球

2、使用conda

查看已安装软件列表

conda list

通过conda安装软件

conda install xxxxx -y #-y的作用是默认安装过程中出现的选项均选择yes

指定安装版本号的方法

conda install xxxxx=版本号 -y

通过conda卸载软件

conda remove xxxxx -y

3、conda环境

用于在处理数据时方便不同版本的软件同时使用，相当于分成多个主体，称为环境“conda environment”

查看conda环境

conda info --envs

新建环境

conda create -n <env_name> <python=需要的版本> <soft_name>#数量>=1同时下载 -y

激活环境

conda activate <env_name>

退出环境

conda deactivate

4、思维导图

DAY-3.png