NGS菜鸟的日常学习之路1-conda

作为一名菜鸟级选手我还是停留在嗯，wget+make的时代突然听说conda，起初是反感的但是不用不知道一用吓一跳啊。

废话不多说进入正题

conda安装

我使用的是miniconda（https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html），选择相应版本下载，我下载的是Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh。

#给执行权限

chmod 777 Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

#运行

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

按提示进行安装就可，不要将其添加到环境变量.bachrc中，如果添加了删掉就好。

然后呢，重点来了

将相应的命令加入环境变量中，你就可以游走于conda环境和正常的linux中了，互不干扰还是不错的。

conda使用

首先嗯

然后

conda install gatk#安装

conda search gatk#安装

conda install gatk=3.7#还是安装多种方式供你选择

conda list#查看已安装软件

conda update gatk#升级软件

conda remove gatk#卸载软件