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CDS是编码一段蛋白产物的序列。
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外显子(expressed region)是真核生物的一部分,它在剪接(Splicing)后仍会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。
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基因分为编码区和非编码区,编码区包含外显子和内含子,一般非编码区具有基因表达的调控功能,如启动子在非编码区。编码区则转录为mRNA并最终由外显子部分翻译成多肽(蛋白质)。
关于cDNA和CDS以及ORF的区别 -
mRNA是由编码区(CDS) 、上游的 5’和下游的3'非编码区组成,真核生物的mRNA的5'端带有7-甲基鸟苷三磷酸帽子结构,3'端有多腺苷酸尾巴,但NCBI中mRNA序列实际上是cDNA序列,即经过反转录得到的与RNA序列互补的DNA序列,一般不包括3’多腺苷酸尾巴。一个cDNA序列被称为一个转录子,第一个碱基所在的位置为转录起始位点(TSS),cDNA都是由外显子组成,但编码蛋白质的外显子只有一个,即CDS (Coding Sequence) ,这段序列也就是一个ORF区,也就是这个cDNA的ORF序列。参与特定基因转录及其调控的TSS上游序列称为启动子。5'utr-CDS-3utr =cDNA,cDNA包含CDS。
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