爱因斯坦在构建完相对论理论大厦后，一直致力于将量子力学理论与狭义相对论理论统一，试图将宏观与微观统一。作为量子力学理论的提出者之一，他对量子力学后期的发展不慎满意，量子力学理论是描述的规律是那样的无序和糟糕。然而他又很无奈，他无法驳倒对方，以至于他不得不借助上帝的权威，他说“上帝不掷骰子”。这句貌似无心的话，却影射出宗教与科学之间，难舍难分，相互对立，而有又相互影响的微妙关系。
宗教神学的起源，最初源于人类对于自然界认识的不足，人类没能认识到自然界的奥秘，所以内心对于自然界充满恐惧，敬畏。这使得人类不得不去追寻自己精神的寄托处，只有这样内心才能踏实，不会因为脑海中突如其来的发问搞得神志不清，精神错乱。诸如这样的问题“我是谁？我从哪里来？我为什么而活？”这就向土壤中扔下了宗教的种子。
当第一个绒毛饮血的原始穴居人，第一次见到被闪电击中燃烧着的枯树时，他无疑是恐惧的。然而当他发现这个奇怪的东西，将凶猛的野兽烧死，留下一堆散发着浓香的食物的时候，他们无疑不为之兴奋。于是，人类就有了对于自然界神秘事物的崇拜，人类造了许多诸如火神、雨神、太阳神的神灵，人们因此有了图腾，有了祭祀，随着人类历史的发展，逐渐形成了具有一定的制度、系统的宗教。
随着历史的前进，人类逐渐掌握了制造工具，生产力水平也逐渐提高，人类在不断地劳动之中，对这个世界的认识也逐渐深入。生产力的发展，使人类不再为食物而烦恼，人类有了思考自身，思考世界的精力与时间。宗教神学与自然科学就是这一思考的结果，二者都试图解释这个世界是如何运行的，只不过是在思考的方式，与思考的角度、立足点不同。宗教神学继承了原始人类对于世界神秘力量的敬畏，这个世界是在超自然力量之下运行，于是有了亚当夏娃为人类始祖，上帝救赎之说，整个世界都在上帝之手的操纵之下运行，一切都是那么的有条不紊，一切都是那么的完美无缺！科学立足于实践，立足于理性的思考，利用归纳演绎等思维方法来概括，总结这个世界的运行规律。虽然它并没有能够解释这世界的一切规律，但它确实可靠地指导着人类，促进人类社会的进步。
宗教神学与自然科学作为人类思考的两大产物，从产生之初，他们之间的博弈就一直延续着。科学与真理的逐渐深入人心，不断地撕开宗教自然观蒙昧与无知的遮羞布。
文艺复兴以后自然神学的兴起，可以看出宗教神学的心虚。上帝在创造好这个世界后，就离家出走了，科学研究的依旧是上帝创造出的规律，所以一代科学巨匠牛顿也被拉到自然神学的阵营，被其视为“上帝的管家”。值得一提的是，牛顿走向宗教神学是必然的，他对宇宙运行的终极动力极为着迷，因为那是他的三大定律存在的前提，然而他又无法找到这个力的起源，所以牛顿最终只有相信，正是上帝的奋力一推，这个宇宙才按照各种力学原理运转起来。
自然神学学派所提出的“钟表匠理论”看似经得起逻辑推理，看似天衣无缝，其实荒唐可笑。他们认为正如你在荒原中捡到一只钟表，你一定会想到会有一个造他出来的钟表匠存在，而这个世界是如此的精妙而复杂，山山水水，万物生灵，都是一个个精妙绝伦的艺术品，而谁又设计出这一切呢？无疑只有上帝。这是设计论着所持有的说法。上帝是完美的，那么上帝为什么要造出活泼可爱的小鹿，又要造出凶残嗜血的狮子呢？为什么又要造出蚊子、跳蚤这样让人不甚其扰的生物呢？
英国哲学家休谟曾经指责这一理论说道：“如果用高级标准来衡量这个世界，无疑是很不完美的，这只能是某个幼稚的神灵做出的粗糙尝试，然后这个神灵对自己的成果感觉羞愧而最终抛弃了它。如果真的要用这一切来证明上帝的存在，无疑这个上帝是个低能儿。”
科学与宗教的对立，客观上促进了科学的发展。正是出于对于宗教的怀疑，无数真理的追求者，才能乐此不疲地去探索，发现，甚至去为真理而做出牺牲。科学正是在布鲁诺殉道之火中涅般重生的。宗教与科学的目的是一样的，二者都试图去解释这个世界，宗教早于科学，但最终将被淹没在科学的海洋里。
随着人类经济社会的发展，科学与生产的结合，人类对与世界的认识进一步深入。麦哲伦的环球之旅，掀起了地理大发现的高潮;达尔文的《进化论》提出了生物的演化史；爱因斯坦的相对论找到了宇宙运行的终极动力。从此，人们不再生活在穹顶之下，人们不再纠结人的起源，人们不再依赖上帝之手，彻底地将上帝赶下神坛，远离了蒙昧与无知。
在宗教与科学的博弈中，科学胜利了，它渐渐取代了宗教的自然观。然而宗教并不是一无是处，相反它作为一种意识形态，同样是人类文明的重要组成部分。宗教源于人类对于自然界的敬畏感，由此引发人类对生命敬畏感。真正的宗教是引导人们向善，引导人们追求幸福。这一点是科学永远无法做到的。
进入现代社会以来，科学与技术，一路高歌猛进，人类思想也开始膨胀，开始夸下海口“征服自然，人定胜天”。然而，人类真的能够做到吗？如今的核安全问题、生化武器、土地沙漠化、全球气候变暖，哪一个不正在威胁人类的生存呢？人作为自然界的一员，谈论征服自然，无疑是可笑的。
人类需要重拾最初对于自然界的敬畏感，对于生命的敬畏感，这也是当前科学伦理所提倡的。当科学与宗教的人文关怀结合时，不再仅仅是人类攫取利益的工具时，那么科学将达到全新的高度。
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