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使用TensorFlow Dataset读取数据

使用TensorFlow Dataset读取数据

作者: 咫尺是梦 | 来源:发表于2018-03-22 21:10 被阅读0次

    在使用TensorFlow构建模型并进行训练时,如何读取数据并将数据恰当地送进模型,是一个首先需要考虑的问题。以往通常所用的方法无外乎以下几种:

    1.建立placeholder,然后使用feed_dict将数据feed进placeholder进行使用。使用这种方法十分灵活,可以一下子将所有数据读入内存,然后分batch进行feed;也可以建立一个Python的generator,一个batch一个batch的将数据读入,并将其feed进placeholder。这种方法很直观,用起来也比较方便灵活,但是这种方法的效率较低,难以满足高速计算的需求。

    2.使用TensorFlow的QueueRunner,通过一系列的Tensor操作,将磁盘上的数据分批次读入并送入模型进行使用。这种方法效率很高,但因为其牵涉到Tensor操作,不够直观,也不方便调试,所有有时候会显得比较困难。使用这种方法时,常用的一些操作包括tf.TextLineReader,tf.FixedLengthRecordReader以及tf.decode_raw等等。如果需要循环,条件操作,还需要使用TensorFlow的tf.while_loop,tf.case等操作,更是难上加难。

    因此,在这种情况下,TensorFlow在后续的更新中,自1.x版本开始,逐步开发引入了tf.data.Dataset模块,使其数据读入的操作变得更为方便,而支持多线程(进程)的操作,也在效率上获得了一定程度的提高。本文就将使用tf.data.Dataset过程中的一些经验进行总结记录,以便备忘。

    如我们所知,在使用TensorFlow建立模型进行训练的时候,可以很容易生成这样的文件,来表示数据:

    1.  data/01.jpg,猫
    2.  data/05.jpg,狗
    3.  data/03.jpg,猫
    4.  data/04.jpg,狗
    5.  data/06.jpg,狗
    6.  data/02.jpg,猫
    

    这种数据格式可以很方便地进行各种操作,比如划分数据集、shuffle等等。所以我们就以将这样的数据通过tf.data.Dataset读入进行训练为例,来讲述其用法。

    具体来说,使用tf.data.Dataset读取数据,本文讲述这样三种方法:

    1.首先将数据读入内存,然后使用tf.data.Dataset构建数据集

    具体来说,因为tf.data.Dataset.from_tensor_slices()函数会对tensor和numpy array的处理一视同仁,所以该函数既可以使用tensor参数,也可以直接使用numpy array作参数,使用numpy array作参数,即是第1种方法。

    如下所示:

    1.  images = ...
    2.  labels = ...
    3.  data = tf.data.Dataset.from_tensor_slices((images, labels))
    4.  data = data.batch(batch_size)
    5.  iterator = tf.data.Iterator.from_structure(data.output_types,
    6.  data.output_shapes)
    7.  init_op = iterator.make_initializer(data)
    8.  with tf.Session()  as sess:
    9.  sess.run(init_op)
    10.  try:
    11.  images, labels = iterator.get_next()
    12.  except tf.errors.OutOfRangeError:
    13.  sess.run(init_op)
    

    第1~2行,首先,将数据images、labels读入内存;

    第3~4行,使用读入内存的数据images、labels构建Dataset,并设置Dataset的batch大小;

    第5行,基于此前构建的Dataset的数据类型和结构,构建一个iterator;

    第6行,基于此前构建的Dataset构建一个初始化op。

    随后的操作,即是在TensorFlow的session里,首先进行初始化操作,然后即可通过iterator的函数逐批获得数据,并进行使用了。

    需要注意的是,iterator中的元素取完之后,会抛出OutOfRangeError异常,TensorFlow没有对这个异常进行处理,我们需要对其进行捕捉和处理。

    本方法详细代码可参阅这里

    2.使用tf.data.Dataset包装一个generator读入数据

    1中方法虽然简单,但其将数据一次读入,在面对大数据集时会束手无策。因此,我们可以建立一个读入数据的generator,然后使用tf.data.Dataset对其进行包装转换,即可实现逐batch读入数据的目的。如下:

    1.  def gen():
    2.  with  open('train.csv')  as f:
    3.  lines = [line.strip().split(',')  for line in f.readlines()]
    4.  index = 0
    5.  while  True:
    6.  image = cv2.imread(lines[index][0])
    7.  image = cv2.resize(image, (224, 224))
    8.  label = lines[index][1]
    9.  yield  (image, label)
    10.  index += 1
    11.  if index == len(lines):
    12.  index = 0
    
    15.  batch_size = 2
    16.  data = tf.data.Dataset.from_generator(gen, (tf.float32, tf.int32),
    17.  (tf.TensorShape([224, 224, 3]), tf.TensorShape([])))
    18.  data = data.batch(batch_size)
    19.  iter = data.make_one_shot_iterator()
    20.  with tf.Session()  as sess:
    21.  images, labels = iter.get_next()
    

    如上,首先构建一个generator:gen,然后使用tf.data.Dataset的from_generator函数,通过指定数据类型,数据的shape等参数,构建一个Dataset,当然,随后也要指定一下batch_size,最后使用make_one_shot_iterator()函数,构建一个iterator。

    然后其使用方法即与前述相同了,不过需要说明的是,这里是通过一个永无尽头的generator构建的Dataset,所以其可以一直取数据,而不会出现1中所述的OutOfRange的问题。

    本方法详细代码可参阅这里

    3.基于Tensor操作构建Dataset

    前述两种方法,1中需要将数据一次全部读入内存,2中使用generator逐batch读入数据,虽然内存占用得到了控制,但是其效率仍然不高,读取速度较慢。在第3种方法里,我们通过TensorFlow提供的tensor操作来读取数据,并基于此,构建Dataset。

    示例的代码片段如下:

    1.  def _parse_function(filename, label):
    2.  image_string = tf.read_file(filename)
    3.  image_decoded = tf.image.decode_jpeg(image_string, channels=3)
    4.  image = tf.cast(image_decoded, tf.float32)
    5.  image = tf.image.resize_images(image, [224, 224])
    6.  return image, filename, label
    
    8.  images = tf.constant(image_names)
    9.  labels = tf.constant(labels)
    10.  images = tf.random_shuffle(images, seed=0)
    11.  labels = tf.random_shuffle(labels, seed=0)
    12.  data = tf.data.Dataset.from_tensor_slices((images, labels))
    
    14.  data = data.map(_parse_function, num_parallel_calls=4)
    15.  data = data.prefetch(buffer_size=batch_size * 10)
    16.  data = data.batch(batch_size)
    
    18.  iterator = tf.data.Iterator.from_structure(data.output_types,
    19.  data.output_shapes)
    
    21.  init_op = iterator.make_initializer(data)
    22.  with tf.Session()  as sess:
    23.  sess.run(init_op)
    24.  try:
    25.  images, filenames, labels = iterator.get_next()
    26.  except tf.errors.OutOfRangeError:
    27.  sess.run(init_op)
    

    首先读入image names以及相应的labels,然后通过tf.constant构建constant Tensor:images, labels,并可选择地对其进行shuffle。

    接着使用tf.data.Dataset.from_tensor_slices()函数基于images和labels构建Dataset。

    然后使用map函数将函数应用到该Dataset上,本例中,将解析图像的函数_parse_function应用到Dataset上,还指定了多线程并行操作的线程数。

    随后指定prefetch的buffer_size,以及batch的大小。

    最后,基于构建的Dataset建立iterator,并定义iterator的初始化操作op,然后就可以按照正常的方式进行使用了。

    需要注意的是,本方法构建的Dataset也会有OutOfRange的异常出现,需要恰当地进行捕捉并处理。

    本方法详细代码可参阅这里

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