本章讲述日本人的由来。
日本人由何而来一直争论不休，几种理论相互冲突。在日本最受欢迎的理论是冰河期人类到达日本，逐步演化成现代日本人。另一理论认为日本人是公元4世纪穿越朝鲜征服日本的中亚游牧民族的后代，但绝非朝鲜人。西方考古学家和朝鲜人认为，现代日本人是公元前400年，带着稻米铁器技术从朝鲜来的移民后代。
日本与朝鲜之间的憎恶由来已久，日本的“鼻冢”至今仍埋藏着16世纪日本入侵朝鲜时，从朝鲜人脸上割下，并被当做战利品带回的两万只鼻子。历史上的恩怨影响了对真相的探寻。
日本独特的文化起源要追踪到其独特的地理环境，日本列岛面积大于英国，离大陆更遥远，降雨充沛，是最湿润的温带国家，只有14%的土地是可用农田，却养活了世界上人口密度最高的社会。高降雨量还使森林快速复生，覆盖率高达70%，陆地、淡水和海洋的高产是通向日本史的钥匙。
以下先从人类学、语言、早期雕塑和历史记录探究一下日本的起源：
日本四岛分别是九州、四国、本州（最大）、北海道，最北面的北海道岛原住民是阿伊努人，采集狩猎为生，体毛之浓密居各人种之首，其他三岛的日本人则与东亚人非常相似。
语言学角度看日语是很孤立的语种。
日本最久远的雕像是1500年前的“埴轮”（类似中国墓葬中的陶俑），外形为典型的东亚人。
中国发明文字远早于汉字向日韩传播的年代，关于日本最早的文字信息来自中国的编年史，汉朝的史料称日本为“倭”，公元700年后日韩出现大量的编年史，说明了中华文明对东亚的深远影响。
再结合考古学的资料，可以讲述现代日本人由来的大致历史：
石器表明，人类到达日本约在50万年前，冰川期海平面低，日本列岛通过陆桥，北端经库页岛与俄罗斯相连，南端与南朝鲜相连，两座陆桥都曾经被使用过，人类是通过陆路进入日本的。
约一万三千年前，冰川融化，日本的环境变的温暖湿润，物产丰饶。日本历史上第一项决定性的变革——陶器发明了，从此进入“绳纹文化时期”，全世界最早的已知陶器是在12700年前在日本制造的。（2012年，中国江西仙人洞遗址发现的陶器距今2万年，而本书成于1996年。）
陶器一般来说是定居社会的专享，是农业生产的产物，而绳纹人是以狩猎采集渔业为生的，他们定居特征超过游牧，要归功于日本丰富的物产，鼎盛期人口达到25万人。
绳纹文化一直延续到公元前400年，仍未掌握农业、文字、金属冶炼技术，却没有被其他先进文明征服，原因是孤悬海外，绳纹日本和中国并无直接接触，而是与朝鲜贸易接触，两者是富裕狩猎采集者和贫穷农民，差距并不大。
公元前400年，第二项决定性变革开始了，来自南朝鲜的稻米和铁器传入日本，日本开始出现大规模的农业生产，进入“弥生文化时期”，弥生文化从最南端的九州岛向北端传播，700年间人口激增了70倍之多。
本书作者认为：这次变革是朝鲜移民携带着稻米和铁器等先进技术进入日本，成为现代日本人的先祖。
人类学和分子生物学表明，绳纹人的头骨异于现代日本人，与现代阿伊努人最为接近，而弥生人的头骨与现代日本人相似。基因测定现代日本人中，朝鲜/弥生基因总体占主导地位。
这样的结论很可能在日本和朝鲜都不受欢迎，但事实上，他们就像一对共享了成长岁月的孪生兄弟，东亚的政治前景取决于他们是否能重新找回联系彼此的古老纽带。
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