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给ATCG碱基序列加header使其成为fasta

给ATCG碱基序列加header使其成为fasta

作者: 苏牧传媒 | 来源:发表于2018-10-29 14:58 被阅读13次

    # 原始序列:

    chr.fa

    wc -l chr.fa

    -> 100

    # 添加header但是header不能一样:

    其实就是一个awk的for循环:

    awk 'BEGIN{OFS="\n";i=1000}{ print ">ENLISH"i,$0}{i+=2}' chr.fa > chr.all.fa

    head

    # 查看结果:

    tail

    wc -l chr.all.fa

    -> 200

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