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Ubuntu20.04 安装 DeSeq2报错解决

Ubuntu20.04 安装 DeSeq2报错解决

作者: Angeladaddy | 来源:发表于2022-06-06 23:08 被阅读0次

问题描述

ubuntu20.04,安装好了R(4.2.0)和Rstudio Server, 按照如下脚本安装包时报错:

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
 install.packages("BiocManager")

  BiocManager::install("DESeq2")
  BiocManager::install("GEOquery")
  BiocManager::install("canvasXpress")
  BiocManager::install("ggplot2")
  BiocManager::install("clinfun")
  BiocManager::install("GGally")
  BiocManager::install("factoextra")

以root用户安装以下包解决:

sudo apt-get install -y libxml2-dev libcurl4-openssl-dev libssl-dev

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