怎么看生信文章中的热图

首先，常用的绘制热图的云平台omicsbean，很多文章中的热图都是用它来画的。简书平台上也有很多omicsbean的云课堂讲解。

文章举例：（转录组，医学方向）:

文章标题：Analysisof potential genes associated with primary cilia in bladder cancer

文章链接：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6124455/

文章热图：见图2

实验设计：共两个组，癌症组和癌旁组，癌症组9个样本，癌旁组3个样本。

热图解读：文章将早期膀胱癌病人的癌组织和癌旁组织RNA-seq数据进行了差异筛选，通过功能富集分析找到7个重要的标记物。热图展示了这7个基因的表达情况，从图中的不同颜色带的强弱可以看到TUBB，AURKA,CENPF，STIL这四个基因在膀胱癌组织中是高表达的，而RAB23,OSR1,STK39是低表达的，这个结果和文章后续的功能分析相呼应。

热图描述：Threehundred and thirty-six upregulated genes and 453 downregulated genes wereidentified in BLCA. The intersection of the DEGs and ciliary genes calculated byVenn diagrams and seven Degs shown by heatmap.

作者：小鸡快跑2008

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来源：简书

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