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KEGG 气泡图

KEGG 气泡图

作者: 余绕 | 来源:发表于2020-04-20 00:32 被阅读0次

加载R包

library(ggplot2)
library(forcats)
library(scales)

加载数据

circ=read.csv("Documents.csv")
circ=as.data.frame(circ)
circ$Term=fct_inorder(circ$Term) #fct_inorder按照事先排好的顺序进行。
head(circ)

画图

ggplot(data=circ)+
  geom_point(mapping=aes(y=circ$Term,x=circ$Pvalue,size=circ$DEGsInPathway,color=circ$Pvalue))+
  scale_color_gradient2(low="red",mid="yellow",high='darkturquoise ',midpoint=0.015) +theme_bw()+theme(text=element_text(size=10,  family="sans"))

#其中theme(text=element_text(size=10,  family="sans"))为修改坐标轴的字体以及大小

查看ggplot2的默认字体

theme_get()$text

查看windows的默认字体

windowsFonts()

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