美文网首页ggplot集锦
AI 如何编辑单细胞热图呢

AI 如何编辑单细胞热图呢

作者: caokai001 | 来源:发表于2020-06-14 01:19 被阅读0次

    参考:

    生信类捕获信号peak图的美化进阶之路
    IGV 修图过程


    如下图所示:


    image.png

    使用pheatmap 获得每一个细胞reads 分布情况,我们常常保存为pdf. 但是我感觉蓝色颜色不正,导入AI里面感觉变淡了。【用pheatmap 设置blue,画出的图感觉不蓝,加深颜色,效果好看一些】

    下面是探索如何用AI进行编辑单细胞track热图


    实践

    Step 1 :从R里面导出pdf 格式热图,每一行是一个细胞read 分布图(图中展示是特定基因区域)

    image.png

    Step2 : 直接拖拽到AI 里面

    发现画板宽度不够


    image.png

    拓宽画板


    image.png

    效果如图:


    image.png

    Step3 : 编辑热图pdf 文件

    我此时发现,没办法进行编辑pdf 颜色了,尝试了一下嵌入功能,结果可行【可能过程会卡机-&*】

    image.png

    接下来就可以调色哦


    image.png

    修改图中颜色为深蓝色


    image.png image.png

    Step4 : 效果比较图

    image.png

    Step5 :将图片插入到IGV,比较bulk ChIP-seq 和signal cell ChIP-seq 效果一致性:

    image.png

    相关文章

      网友评论

        本文标题:AI 如何编辑单细胞热图呢

        本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/xlvtxktx.html