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ITS测序数据上传SRA

ITS测序数据上传SRA

作者: 聆听小倩 | 来源:发表于2020-07-12 00:22 被阅读0次

    注:不同类型数据上传不同数据库,此处微生物多样性的上传SRA。测序报告书上有。

    https://mp.weixin.qq.com/s/CUGkuaNnAZZ3W5IpPyaS-A

    具体步骤看上边链接

    以下是弯路和细节补充:

    官网NCBI,注册,注册完一定要去邮箱信息激活!!

    页面点击My submission,下拉可以看到SRA三个字,点进去。new  submission.

    接下来分为8个步骤。

    第一步就是信息注册。

    第二步你已经有bioproject和biosample了吗,我没有,选择NO。释放时间随意。后来可以再data  management中查看

    第三步描述一下,类似于论文题目摘要,简短点。

    第四步类型:此处选择metagenome  and environmental  sample

    第五步,容易报错。样本名字自己起,加一列ID  123456……!!! 其他的按照上边链接填写 例如soil metagenome等

    第六步按照上边链接填写。我第一次没按照上边填写,报错了。双端,filenme  filename2填上。我的Nts1.1 .fq  另一端Nts1.2.fq。原始数据raw.split.fq要按照这个重新命名。双端后缀.1.  .2.区分一下

    上传数据,我是用的傻瓜上传。就是网页上点击下载了Aspera软件,然后,点击上传,所有数据一起shift一起选中上传了。我的总共4g,上传用了1小时。

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