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NIPT:Non Invasive Prenatal Testi

NIPT:Non Invasive Prenatal Testi

作者: 半夏长安 | 来源:发表于2020-05-07 22:38 被阅读0次

无创产前DNA检测(testing),又称:无创母血胎儿染色体非整倍体检测,(21唐、18爱德华、13帕陶)。

2013年由ACMG首次发表声明更改NIPT为NIPS(Screening)。

胎盘滋养层细胞的游离DNA片段(cell-free DNA,cfDNA),以75~205bp 的小片段,不断的透过“胎盘-母体屏障”,并不断被降解和清除,从而以快速动态平衡的形式存在于孕妇外周血血浆中。

cfDNA的清除半衰期为16分钟,含量是母血中游离胎儿细胞可提取DNA的25倍以上。

研究表明:

孕4周,孕妇外周血可以检出cfDNA;

孕7周,建立胎盘循环后,cfDNA可以一定的比例稳定存在于母血中,至10周达到一个高峰;

孕10-21周,cfDNA处于相对平衡的水平。适宜检测时间:12~22+6周。

孕21周后,cfDNA将再次持续升高直至晚孕期;

分娩后2h,胎盘cfDNA将全部清除而无法测到。

母体血浆中胎儿游离DNA含量约占血浆中全部游离DNA的5-20%,比例随着孕周的增大而缓慢上升。

如果胎儿为21三体,则母血浆中来源于胎儿21号染色体的游离片段会有50%(3-2 /2)的上升,并引起外周血中全部21号染色体来源的片段数量微量增加(3/46—2/46)。如一个胎盘游离DNA含量在10%的唐氏综合妊娠孕妇,其外周血浆中来源于21号染色体的DNA片段含量将比正常妊娠增加1.05倍,此方法通过平行测序技术的深度测序来检测这些DNA的来源,并显示出含量的微小改变,进而实现产前检测。对21三体(100)、18三体(97.2 or 100)、13三体(78.6 or 91.7 or 100)综合检出率均为100%,假阳性率分别为:千分之3、2.8、9.7,总体标本检测失败率5%。

尽量提高敏感度,检出的假阳性可通过产前诊断排除

当然也可以标记几条染色体上的保守序列,进而大幅度降低测序深度,提高测序效率降低成本,对21三体及18三体有较好的敏感性和特异性,由于不同染色体GC含量的差别,其他染色体的非整倍体异常的检测效率有很大不同。

特别要注意的是NIPT再准确目前也只是一种筛查手段,并不能作为确诊手段。因为其仍有极低概率的假阴性,即早唐和NIPT结果均提示18三体低风险,但脐静脉穿刺显示胎儿核型为47,XN,+18

1.专用的采血管:美国公司Streck自主研发生产的Streck  Cell-Free DNA BCT采血管和美国Ardent BioMed公司研制设计Ardent Cell-Free DNA BCT采血管。目前是否需要专用管并不清楚。

2.在指定温度范围保存、运输。

3.合格样本则分离出血浆、白细胞(部分实验室需要保持)保存。短期可-20度保存,长期则需要-80度保存。保存期为3年到5年不等。

4.提取血浆中游离的DNA片段进行纯化,磁珠充分吸附游离DNA片段,将收集到的DNA片段进行PCR扩增、添加生物识别标签和文库纯化,最后检验文库样本是否合格和浓度大小。

5.合格的文库样本,按一定的比例混合在一起,制备成混合Pooling文库。

补充知识:

颈项透明层(nuchal translucency, NT),大于3mm为增厚。其是胎儿非整倍体的独立标志物,结构异常风险增加,患先心病风险增加,是进一步行介入性产前诊断和遗传学分析的指征。

FISH能够诊断常见的21、18、13、X、Y染色体非整倍体异常,但不能诊断其他染色体数目异常及染色体结构异常。21三体能活40岁,18/13三体大概率会流产,出生后能活1-2岁,性染色体异常如正常,但可能无法生育后代。

胚胎发育过程中会发生染色体嵌合现象,有两种染色体嵌合现象:真性(胎儿和胎盘)染色体嵌合、局限性胎盘嵌合(confined placental mosaicism ,CPM),CPM是导致绒毛活检结果不确定从而出现假阳性诊断的主要原因。

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