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序号:2020-128
编者按:
线粒体单细胞研究,蛮有意思的
大规模平行单细胞线粒体DNA基因分型和染色质分析
【文献类别】细胞发育-线粒体
【发表期刊】Nature biotechnology
【影响因子】 36.6
【发表时间】2020-08-12
【PMID】32788748
【文章摘要】天然线粒体DNA(mtRNA)突变使我们能够推断细胞间的克隆关系。mtRNA可以与细胞状态的测序一起进行分析,但尚未与大规模平行的研究相结合来分析人体组织的复杂性。在此,研究人员引入了一种高通量,基于液滴的线粒体单细胞测定法,用于转座酶可及性的染色质测序(scATAC-seq),该方法分析了数千个单细胞,通过结合高可信度的mtDNA诱变和高质量染色质分布图,由此可以推断出mtDNA的异质性、克隆关系、细胞状态以及单个细胞中可及性染色质变异。研究人员揭示了病理性mtDNA变异的异质性单细胞变异,并将其与个体内部染色质变异和克隆进化联系在一起。另外,他们还克隆地追踪了成千上万的癌症细胞,将表冠基因组变异性与亚克隆进化联系起来,并推断出体外和体内分化造血干细胞的细胞动力学。综上所述,本篇论文提出了一个可以研究体内细胞群体动力学和克隆特性的方法。
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