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同位素标记相对和绝对定量iTRAQ蛋白质组学定量技术

同位素标记相对和绝对定量iTRAQ蛋白质组学定量技术

作者: c674838bdc26 | 来源:发表于2020-04-20 10:32 被阅读0次

同位素标记相对和绝对定量isobaric tags for relative and absolute quantitation(iTRAQ)技术是美国AB SCIEX公司于2004年推出的一种全新的体外同位素标记的相对与绝对蛋白组定量技术。定量蛋白组学是蛋白质组学的一个重要组成部分,即对一套基因组表达的全体蛋白或某一复杂的混合物体系中所有蛋白质进行定量和鉴定。

同位素标记相对和绝对定量iTRAQ蛋白质组学定量实际上是一种同位素标记试剂,可与氨基连接的胺标记同重元素。目前有两种主要使用的iTRAQ试剂:4-plex和8-plex,可同时标记4组或8组样品。

同位素标记相对和绝对定量iTRAQ蛋白质组学定量技术工作流程和原理:

 

[if !supportLists]1. [endif]分别水解蛋白样品,得到肽段的混合物。

[if !supportLists]2. [endif]用iTRAQ对蛋白样品进行标记,使不同iTRAQ试剂标记样品中的所有肽,并混合所有标记后的蛋白样品。

[if !supportLists]3. [endif]对混合标记后的蛋白样品进行串联质谱,得到一级和二级质谱图。

[if !supportLists]4. [endif]对质谱原始数据进行定量分析。

不同样品来源的同一肽段在iTRAQ标记后,分子量完全相同,因此在一级质谱图中呈现为一个。然后对该肽段进行二级碎裂之后,报告基团、平衡基团和多肽反应基团之间的键断裂,平衡基团丢失,带不同同位素标记的同一多肽产生质量为113,114,115,116,117,118,119和121Da的报告离子(8-plex)。报告离子呈现出不同的峰,将波峰的高度面积等相关数据经过软件处理,结合数据库对比分析,可获得不同样品间相同肽段的定量信息。

同位素标记相对和绝对定量iTRAQ蛋白质组学定量技术特点

 

[if !supportLists]• [endif]高通量定量蛋白分析:可以同时分析多个样品;适合大量临床样本,多对照组大规模实验分析,发现新的生物标记物

[if !supportLists]• [endif]体外标记,适用于分析组织,细胞,血液等多种样品

[if !supportLists]• [endif]质谱分析灵敏度高,可检测较低丰度蛋白,大范围比较蛋白相对丰度

[if !supportLists]• [endif]可与富集磷酸化等修饰肽段的方法联用,更准确研究翻译后修饰变化

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台,Orbitrap Fusio Lumos质谱平台结合Nano-LC,可提供iTRAQ蛋白质组学定量分析技术服务包裹。

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