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重点提醒:学习软件最好的方式就是看视频学习,我将会录制可视化系列视频,并结合核心论文进行讲解图谱,节省你自学的大量时间,时间最宝贵!
视频里我详细介绍了每个功能的应用,以免有些同学能做出图而不知如何解读!全是干货,提升自己的时候到啦啦啦啦啦啦!
Cytoscape是一款图形化显示网络并进行分析和编辑的软件,它支持多种网络描述格式,也可以用以Tab制表符分隔的文本文档或Microsoft Excel文件作为输入,或者利用软件本身的编辑器模块直接构建网络。
Cytoscape还能够为网络添加丰富的注释信息,并且可以利用自身以及第三方开发的大量功能插件,针对网络问题进行深入分析。
突出优点:可编辑性非常强,在可编辑方面吊打其他知识图谱软件。
并且突破了文献数据库的限制,不仅仅可做文献计量。可做各种网络图谱。
今天我给大家录制了如何利用Cytoscape进行数据的各种可视化分析。
通过学习你将能够独立完成以下工作。
绘制:【点击文章左下角“阅读原文”查看视频】
无向网络图谱,
有箭头指向的图谱,
线条加权图谱
打破文献计量指标,导入自定义节点和线条属性做图谱。
编辑图谱,包括增加、删除节点,线条等。
计算各种网络组指标
具体案例如下:(以下是我视频讲解中的截图)
跟着视频你也能做出如此惊艳的图谱:
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