用python做生物信息数据分析（4-文件输入和输出）

写在前面

前面几个推文，一上来目的性就比较强，直接使用pysam输入和输出文件。但是，很多时候，我们需要自己读取一些文本文件，或者输出一些文本文件。所以，需要了解一下python文件打开，输入，输出 和 关闭 等操作。

几种python文件的读取方式

这类信息，其实直接在百度可以找到很多，所以百度，随后调试即是

打开文件 和 关闭文件

1.file = open("文件名"，"打开方式")，注意，最后需要关闭文件 file.close()

2. with open("文件名"，"打开方式",conding="编码格式") as file:，注意，这类打开方式会自动关闭？所以不用关闭文件。

以上打开方式，一般就是

• r 只读
• w 只写
• r+ 读写
• a 追加
• a+ 追加读写

文件读取

四种读取文件的模式

f.read(size)  #  读取指定长度的字符
f.readline(size) # 读取指定行数的内容
f.readlines() # 一次读取所有行
for line in f: # 逐行读取

文件写入

两种文件输出的模式

filename = 'write_data.txt'
with open(filename,'w') as f:
    f.write("I am Meringue.\n")
    f.write("I am now studying in NJTECH.\n")

doc = open('out.txt','w')
print(data_dict,file=doc)
doc.close()