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hg18如何转换hg19

hg18如何转换hg19

作者: 艺语呢喃er | 来源:发表于2019-01-14 23:55 被阅读0次

    检索16q11.2-16q12.1相关的文献。

    好不容易找到一篇【Zerem (2011) Am J Med Genet A 155A, 2991】报道1例4岁男孩,16q11.2-16q12.1嵌合重复,具体位置[chr16:45,279,306-48,569,472, hg18],轻中度智力障碍、小头畸形、语言障碍,MRI显示小脑皮质发育不良(16q部分三体患者首报小脑畸形)。

    不过我需要的格式是hg19,文献里面是hg18,怎么转换呢?

    打开网页https://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgLiftOver,选择文献中待转换的版本号和转换后的版本号,输入染色体区段,提交,下载转换后的结果。

    待转换版本号 转换后版本号 提交及下载结果页面

    下载的结果是.bed文件,可以用文本编辑器打开(如editplus软件),就是转换后的hg19结果啦

    转换后的hg19结果

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