不同于找到的教程,更新后的GSEA不单独提供GUI的jar包,而是打包在zip中和命令行一起提供
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按照readme文件
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总结:readme和网站都简洁高效并且正确。
下载地址和下载内容为
Downloads (gsea-msigdb.org)
新的javaGSEA不需要自己安装jdk,自带了JDK11在zip文件中。
建议不要再使用二手包做GSEA,官网给出的方式已经非常简洁并且泵保证正确。
java强在跨平台属性上,不需要(我猜测)修改代码就能在不同平台实现同样的内容,因此一旦看到有java 的项目,应该能想到他有linux上的gui;此外,看到他自带了JDK也应该放心,不需要自己安装,他应该是把jdk的调用路径已经写进软件了。非常方便
###############更新
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并非不需要安装JDK,还是要先安装JDK才能使用的
conda search openjdk
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conda install openjdk=11 image.png
安装成功 但是不行
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R4.0安装jdk11,使用成功
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总结:
先conda安装JDK11 再打开GSEA就能用,如果不能,那就换一个环境重新做,因为安装和打开的流程是正确的,出问题就是环境出问题了。
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