在做生物信息分析时，我们经常会用到滑动窗口统计不同区间内的变异数量，但是对于生物信息初学者（不具备编程能力）存在一定难度，这里有简单便捷实现滑动窗口的方法。
samtools faidx Brapa.fa
#生成500kb的区域
bedtools makewindows -g Brapa.fai -w 500000 > region.bed
bedtools coverage -a region.bed -b aaa.vcf -counts > aaa.vcf_500kb_window.txt
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本文标题：用samtools+bedtools快速计算不同区域中的变异数量
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/ymambrtx.html
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