R语言学习的第二天

感觉无比困难，虽然说反复试就可以发现规律，但是这几天值班，时间很紧张，先只跟基础内容吧 。学习的网址是生信星球

名词解释

元素：内容，可以是数字也可是字符串。
向量（vector）：向量是一排有序排列的元素
数据框（data frame）：各种表格

相关的代码

1.HELP：有不会，就找Help。函数或者命令不理解时，输入?read.table，并运行即可展示出来，不过是英语的，英语基础不好的人还是建议上网自己查。
2.赋值

1.x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
2.x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
3.x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
4.x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次

查看结果的话就输入x（这个x是被赋值的）然后enter
举个栗子：

image.png
如果反复赋值，则最后被赋值的这个向量就会取最后一次被赋值的结果
image.png
赋值后，右上角也就是environment这里会显示赋值的情况，values就是你赋值的变量，data是你赋值的表格，不能重名，这里仔细看，是大写C和小写c喔
image.png 想看数据的话点一下environment的变量，左下角编辑区就会自动出现view的字样，enter后就能看了，若是表格的话会显示在左上角，像下图一样 image.png

若是想看数据集中的某个数据，则可根据以下代码找到需要的数

（1）根据元素位置#这里的x是你刚才赋值的变量名，根据自己的情况来修改
x[4] #x第4个元素
x[-4] #排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4] #第2到4个元素
x[-(2:4)] #除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
（2）根据值
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素
以上引自生信星球

3.插入数据框的相关操作
上一篇提到了创建不同的project方便管理，没错，假如需要给变量赋值一个数据表，则需要把该数据表的csv文本或txt文本存在这个project的文件夹中，这样子才行，当然你也可以把整个路径输进去调取文本，但是这样子做不方便，且很乱，所以不推荐。

首先先明白csv和txt两个文本格式的区别
CSV是“逗号分隔的TXT文件”。而TXT则是tab分隔或者理解为空格分隔的文本。
然后，

image.png
可以看到。左边这个就是逗号分隔的csv文件，右边是txt，但是左边这个的后缀也是txt格式，为什么呢？其实无所谓，你也可以吧他改成csv结尾，txt文本你的电脑可以直接打开，方便看，csv是逗号分割的txt文本，你左右对比一下，是不是就理解了？
打开txt的文本代码`read.table('文本的名字',header=T,sep='\t')
image.png
其中着重理解一下：sep="\t" 表示以tab（制表符）为分隔符，header表示所代入表格数据，第一行是否为列名称，true则是表格数据第一行为列名称，具体数据从第二行开始，false则第一行即为具体数据。

而赋值表格则就是

x<-read.table('文本的名字',header=T,sep='\t')
4.设置数据框行的名字或者列的名字

X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

举个栗子： image.png

5.导出数据框

1、导出文本文件
1）write.table函数语法：
write.table (x, file ="", sep ="", row.names =TRUE, col.names =TRUE, quote =TRUE)
x：需要导出的数据
file：导出的文件路径
sep：分隔符，默认为空格（" "），也就是以空格为分割列
row.names：是否导出行序号，默认为TRUE，也就是导出行序号
col.names：是否导出列名，默认为TRUE，也就是导出列名
quote：字符串是否使用引号表示，默认为TRUE，也就是使用引号表示
引用自百度经验

举个栗子：
先生成一个数据框（生成数据！）

image.png

1.以空格分隔数据列（默认），含行号（默认），含列名（默认），字符串带引号

image.png

2.以逗号分隔数据列，含行号（默认），含列名（默认），字符串带引号

image.png

3.以空格分隔数据列，不含行号，不含列名，字符串不带引号

image.png

4.以空格分隔数据列，含行号，不含列名，字符串带引号

image.png

5.变量的保存与重新加载

这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

image.png

6.提取元素

• X[x,y]#第x行第y列
• X[x,]#第x行
• X[,y]#第y列
• X[y] #也是第y列
• X[a:b]#第a列到第b列
• X[c(a,b)]#第a列和第b列
• X$列名#也可以提取列（优秀写法，而且这个命令还优秀到不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）

7.直接使用数据框中的变量

options(stringsAsFactors = T) a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9)) plot(a$case,a$values)

这个分为3行去理解，
第二行是a赋值一个表格

image.png
第三行是作图，然后调用a里的数列 image.png

剩下的简便方法以后再讲，今天实在有点忙。