细胞核直径约6μm,核内DNA长2m,所以DNA是强烈压缩的,它的三维空间结构如何?
图片.pngHi-C技术
所有都是基于染色质构象捕获技术(3C)的:
冻住(用福尔马林瞬时固定细胞核染色质)——切开(用过量的限制性内切酶酶切消化染色质 - 蛋白质交联物)——连接(在 DNA 浓度极低而连接酶浓度极高的条件下用连接酶连接消化物),蛋白酶消化交联物以释放出结合的蛋白质,用推测可能有互作的目的片段引物进行普通PCR和定量PCR来确定是否存在相互作用。
近距离连接原理
CTCF环挤压
图片.png1、循环是动态的,而不是静态的
2、内聚形成逐渐增大的环
3、CTCF定义边界
4、聚合物模拟支持环挤压模型
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