grep 'Overall alignment rate: ' *.log |sed 's/Overall alignment rate: //'|sed 's/.log://'
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处理原始数据文件 rawdata质控 统计cleandatabase 建立索引 hisat2比对 排序 统计比对率...
hisat2 构建索引 hisat2 比对 hisat2 比对软件将 reads 比对到参考基因组[https:/...
统计比对率 新建文件夹 构建脚本前文件 构建脚本 激活并运行脚本 进入结果文件夹提取所需内容
比对软件：hisat2 比对率至少70% 饱和性曲线：20M reads数据量即可检测到80%数据量碱基数目：...
本节概览：hisat2 + featureCounts:获取hisat2索引文件，hisat2比对和samtool...
基因组比对软件常用bwa，转录组比对软件常用bowtie2、hisat2等，其中有参考基因组的常用hisat2，没...
##从hisat2官网下载打包好的reference，然后比对## hisat2 -p 16 -x ../refe...
这里是佳奥！我们继续clean数据的比对。 1 使用bowtie2进行比对 用bowtie2进行比对和统计比对率,...
比对参考基因组的2种软件：hisat2、subjunc hisat2软件 1、构建索引： 官网下载：https:/...
hisat2 / bowtie 比对过程出现 read has more quality values than ...
本文标题：2022-07-06 hisat2比对率统计
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/yseybrtx.html
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