3d-dna软件提速（一）edit-fasta-accordin

在3d-dna流程中，凡是涉及到edit-fasta-according-to-new-cprops.awk的流程速度都会非常的慢，为了提高它的运行速度，我根据它的代码逻辑用Python进行实现。

首先，我找到了所有用到edit-fasta-according-to-new-cprops.awk的脚本

• run-asm-pipeline-post-review.sh

• run-asm-pipeline.sh

• finalize/remove-N-overhangs-from-asm.sh

然后根据edit-fasta-according-to-new-cprops.awk的代码逻辑，我编写了一个edit-fasta-according-to-new-cprops.py, 实现了相同的功能。经过测试，我的代码输出结果和原来的awk脚本完全一样。

最后，我将所有涉及edit-fasta-according-to-new-cprops.awk的脚本全部修改为我的代码。

项目地址： https://github.com/xuzhougeng/3d-dna