废话不多说,直接简单粗暴的开始吧 导入基因组 导入基因组文件:Genomes→load geome from fi...[作者空间]
0.准备输入数据 可以是矩阵 行是一边,列是一边,矩阵正文的数字表示连接的强度。 可以是tidy数据框 一行是一个...[作者空间]
概念 PCA(principal components analysis)即主成分分析。主成分分析也称主分量分析,...[作者空间]
No.1 前言 由于本人在这段时候,看到了一个叫做树莓派的东东,初步了解之后觉得很有意思,于是想把整个过程记录下来...[作者空间]
KEGG数据库应该是我们最常见的、使用频率最高的数据库之一了,它是一个整合了基因组、化学和系统功能信息的数据库。由...[作者空间]
作者:charon审稿:童蒙编辑:angelica 引言 在做基因或者蛋白质功能注释的时候,NR数据库包含非常重要...[作者空间]
参考文章:1.如何统计BAM文件中的reads数2.Samtools常用命令的总结 当你有很多个bam文件时,想知...[作者空间]
CNV拷贝数变异分析是什么?贴一段TCGA官网的介绍 "The copy number variation (CN...[作者空间]
最近在学习使用GOplot这个包中的GOChord()函数可视化GO富集分析结果,又有了一点收获,记录在这里。 通...[作者空间]
在3d-dna流程中,凡是涉及到edit-fasta-according-to-new-cprops.awk的流程...[作者空间]
往期教程 「群体遗传学实战」第一课: 对SNP位点进行注释 「群体遗传学实战」第二课: 画出和文章几乎一样的PCA...[作者空间]
基因组组装 1.k-mer 那么我们首先要看一下k-mer是什么。它的定义是:是指将一条序列分成包含k个碱基的子字...[作者空间]
刘小泽写于2020.3.19偶然看到大佬又在推荐精品资源,于是进去看了看,确实写得很走心,和你分享可以详细学习学习...[作者空间]
获取表达数据矩阵 这里运行R语言包GDCRNATools的帮助文档中的例子获得胆管癌的rna表达矩阵 使用R语言包...[作者空间]
今天向大家推介一个实用的工具,用来从NCBI的ftp直接下载指定物种范围的微生物基因组。 https://gith...[作者空间]
转录组有参分析之STAR比对及可变剪切 STAR比对的特点: 速度快 准确度高 3'reads soft clip...[作者空间]
使用STRING构建蛋白互作网络(PPI) STRING 链接 https://string-db.org/数据集...[作者空间]
引言 同源基因家族的拷贝数在不同物种间普遍存在差异,这种差异是由不同的基因得失速率引起。基因家族的拷贝数变异为物种...[作者空间]
旁系同源基因简单来说就是同一物种内,通过基因复制产生的不同的两种基因。 计算直系同源的办法网上已经很详细,今天我来...[作者空间]
你是否有这样的苦恼?自己写好的项目不能方便的展示到外网,你是否又有这样的苦恼?哎呀花生壳怎么还要钱啊,现在完全不用...[作者空间]