截短体及引物设计

在确定研究蛋白确实可以发生相变后，要最终确定是那段序列发生相变，我们需要根据蛋白质的结构特点，将蛋白质分为很多很多小的片段，并且在这些片段上面携带GFP来观察其过表达后是否可以形成SG颗粒。
比如这个蛋白的DNA序列将其分为3段

image.png

比如第而段（白色）设计的引物为：

(cla1)-F: CC ATCGAT A TTGAAGGACAGTCTGCGGC
(Kpn1)-R: GG GGTACC CTA ATGGAGAGCTGGGACAGC

其中的CTA（反向互补）为终止密码子，如果不设计终止密码子，他会扩增出绿色和白色的所有区域，

终止密码子有：
RNA中：
UAG：琥珀密码子（amber codon）
UAA：赭石密码子（ochre codon）
UGA：蛋白石密码子（opal codon）
DNA中：
TAG：琥珀密码子
TAA：赭石密码子
TGA：蛋白石密码子